医生升职加薪加速器：组学大数据
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时间：2024-12-12
是什么方法让
国自然基金能快速申报？
SCI论文也能迅速发表？
还能结合人工智能助力精准医疗？
就让我们一同来见证
组学大数据的应用潜力吧！
组学大数据是利用高通量技术产生的大规模生物学数据集，覆盖基因组、转录组、蛋白质组和代谢组等领域，是连接临床样本与临床研究的关键桥梁。根据Pubmed中以“proteomics”为关键词进行检索发现，蛋白质组学发文量逐年攀升。仅2023年，与蛋白质组学相关的文章达到15687篇。至今，2024年发文数量已达8640篇，预计将继续增长，显示了组学大数据在临床研究中的快速发展。
毫无疑问，组学大数据已经成为了临床医生做科研的一大助力。因其高效性与应用潜力，可以帮助临床医生在工作繁忙的同时也能轻松完成科研任务，极大地缓解他们在考核制度、晋升职称、基金申请时面临的困难。在这篇文章中，小谱将为大家讲解组学大数据在高效临床科研中扮演的关键角色，我们一起来看一看吧！
01
组学大数据赋能国自然基金申报
国自然近五年“组学”相关结题项目数维持在两百项左右，且近两年有增长趋势
近年组学相关国自然项目：
基于靶向蛋白质组学筛选技术的阿尔茨海默病早期诊断生物标志物研究
基于SISCAPA-MRM技术的定向蛋白质组学在肝癌血清生物标志物验证研究
基于代谢组学和蛋白质组学联用技术的糖尿病并发肺结核的生物标志物和代谢通路研究
ROS介导的谷胱甘肽化在上皮间充质转化中的功能和作用机制研究
INSIG2促进宫颈腺癌恶性进展的分子机制研究
FHF2通过CaMKIIδ调控病理性心肌肥大的机制研究
通过已获批的国自然项目我们不难发现，蛋白质组学在临床研究中主要用于寻找疾病生物标志物，在基础研究中用于发现关键分子、提出科研假设。基于这种套路，我司成功帮助多个合作客户申报国自然项目。（点击右侧查看详情——国自然放榜喜报 | 谱度众合合作客户团队又双叒成功获批国家自然科学基金！）
公司客户申请基金实例——日本血吸虫感染通过Necroptosis信号通路调控宿主结直肠癌的作用机制研究
02
组学检测+数据挖掘“干湿结合”加速SCI论文发表
通过对公开组学数据库的挖掘，研究人员能够从这些数据中提取有效信息，助力临床研究并快速发表SCI论文。以蛋白质组学为例，研究者可通过数据库挖掘找到关键蛋白后在临床样本中验证，或通过临床样本找到关键蛋白后利用数据库数据进行验证。
公司客户文章实例——急性呼吸窘迫综合征肺组织和血液的综合蛋白质组分析
该研究构建ARDS/ALI小鼠模型，采集小鼠的血清和肺组织样本进行DIA定量蛋白质组学分析，并分别筛选差异表达蛋白，从中随机挑选差异表达蛋白进行PRM靶向蛋白质组学验证。通过挖掘转录组公开数据库GEO（GSE 104214和GSE 2411）对小鼠肺组织的蛋白质组学数据进行转录组学的数据比对，识别了6个在肺组织和血液中有共同上调趋势的目标差异表达蛋白。（该文章由谱度众合完成蛋白质组学检测及分析工作，点击右侧查看详情——谱度众合又双叒助力文章发表 │ ARDS小鼠模型DIA+PRM+数据库验证，蛋白标志物研究有套路）
文章实验设计流程图
03
人工智能助力组学大数据应用，发表高质量研究成果
随着现代高通量组学测量平台的发展，产出了海量的数据，为深入了解疾病的发生发展过程，临床医学研究必须进行整合。来自各种组学来源的数据，如基因组学、蛋白质组学和代谢组学，不仅规模庞大，而且整合方式复杂，需要进行跨学科合作。对于这种复杂数据的挖掘和分析，人工智能技术（如：机器学习）成为了从庞大、丰富的组学大数据中提取信息的有效工具，来整合和分析各种组学数据，从而能够发现新的生物标志物，帮助准确地预测疾病、患者分层和提供精准医疗。数据显示，“多组学+机器学习”、“多组学+深度学习”出版物数据从2015年开始大幅上升，昭示人工智能技术在多组学精准医学领域的普及和应用。
（DOI：10.1016/j.biotechadv.2021.107739）
公司客户文章实例——体外循环术后急性呼吸窘迫综合征（CPB-ARDS）的早期血浆蛋白标志物筛选和预测模型构建
该研究应用机器学习建立预测模型来识别CPB-ARDS高风险人群。模型结合了患者临床变量，在验证队列的验证中表现良好，研究成果为积极监测和预防ARDS发生提供决策支持。（该文章由谱度众合完成蛋白质组学检测及分析工作，点击右侧查看详情——谱度众合助力文章见刊（IF15.3）| 体外循环术后ARDS的早期血浆蛋白标志物筛选和预测模型构建）
文章流程图
总的来说，组学大数据为识别疾病生物标志物、探索疾病机制以及推动精准医疗提供了关键信息，为临床医学的进步提供了坚实的支持与指引。而蛋白质处于中心法则下游，且是生命活动的最终执行者，其在生命及疾病发生发展过程中的意义不言而喻。
谱度众合多年深耕于蛋白质组学领域，是全国首家明确提出临床蛋白质组学概念，并系统性将蛋白质组学技术应用于各个临床科室的“专精特新企业”，致力于为临床医生提供科研服务。如您对蛋白质组学或者我们公司的服务感兴趣，欢迎随时与我们联系，了解更多详情或与我们合作~
